cDNA Microarray Technique

Kemaren selasa jam 13.00 gue ikut Jurnal Club di IHVCB seperti minggu lalu,yang kali ini judul artikel yang di bahas Genomic Analysis Defines a Cancer-Spesific Gene Expression Signature for Human Squamous Cell Carcinoma and Distinguishes Malignant Hyperproliferation from Benign Hyperplasia.Artikel ini lumayan baru yang baru published online 9 February 2006 di Journal of Investigative Dermatology.Kali ini penyajinya Prof.Santoso,orang IHVCB.Yang menarik dari pembahasan yang beliau sampaikan,beliau tidak melulu menyampaikan apa yang ada di artikel,tapi juga memberikan materi detail tentang cDNA Microarray technique yang merupakan dasar methods yang dipakai dalam riset artikel tersebut.Sayang alat ini di IHVCB belum ada-ga tahu ya kalo tempat lain di Indonesia udah ada apa belum-.Gue sendiri udah tahu (tapi belum membaca dan paham) tentang cDNA Microarray ini sejak gue semester 5 di Kedokteran dulu yang berarti sudah 6 tahun lalu,saat gue getol-getolnya download materi-materi tentang Bioinformatika dari internet.Saat itu gue emang tergila-gila ama yang namanya kata "bioinformatika".Pemahaman gue saat itu tentang bioinformatika adalah ilmu gabungan antara biology kedokteran ama informatika,yang bisa membuat chip/prosesor komputer dari DNA-pemahaman ini ternyata tidak sepenuhnya benar,karena ada bioinformatika,ilmu yang mempelajari tentang penggunaan ilmu komputer untuk mengolah database biology molecular termasuk DNA -.Kelihatannya asyik banget gitu kalo bisa belajar dan ambil jurusan itu setelah lulus kedokteran ama elektro yang masih gue double saat itu.Artinya gue bisa menggabungkan ilmu kedokteran dan ilmu komputer dalam satu bidang,yaitu BIOINFORMATIKA.Saking tergila-gilanya saat itu ama bioinformatika...kata "bioinformatika" ini gue buat password email-email atau file-file komputer gue-yang sekarang udah gue rubah karena gue ga tertarik lagi ama bioinformatika,karena gue belum (baca : tidak) menyelesaikan elektro gue,dan karena pesan dari seseorang "disana" sekarang gue lebih terinspirasi dan tertarik untuk fokus pada molecular medicine seperti gene therapy-.Dulu dari dowload-an itulah gue mengenal frase "Microarray DNA". terutama dari site-nya EMBL.Tapi file download itu cuma kesimpan aja di hardisk karena gue belum tahu betul apa maksud dan kegunaannya..maklum baru semester 5 yang bahasan materi yang gue dapatkan dari kedokteran masih yang makro-makro aja dan superficial.
Dan sekarang sebagai seorang pemula dalam molecular medicine ini,setelah mendapat kuliah singkat dari Prof.Santoso,untuk lebih paham terpaksa deh gue kembali membongkar apa yang telah gue download 6 tahun yang lalu.Membongkar file teknik Microarray DNA..

Sampai kapan nge-blog?

Gue udah hampir 4 bulan nulis di blog.Dan kebanyakan adalah pengalaman hidup gue yang gue tulis yang sebelumnya hanya gue tulis di diary buku dan diary komputer si g'B.Karena gue seneng nulis,dan terpaksa seneng nulis (apa maksudnya ini..hehehhe) ngeblog ini seharusnya bisa dilakukan sepanjang usia kita.Kalau Tuhan kasih gue umur 80 tahun,misalnya maka gue seharusnya sepanjang sisa umur itu nge-blog terus.Yang jadi pertanyaan sampai kapan fenomena ngeblog ini akan bertahan?Maksud gue kalau gue sekarang gue pakai blogger sebagai tempat nyimpan data blog gue,sampai kapan blogger akan survive?OK deh kalau misalnya gue pakai webhosting komersial,sampai kapan penyedia webhosting itu akan survive?Apakah data kita akan hilang jika blogger itu kolaps dan berhenti beraktivitas misalnya.Ini pertanyaan konyol,tapi gue tidak tahu jawabannya.Mungkin orang yang udah tahu akan mentertawakan tulisan ini,tapi gue yakin sebagian member bloger atau jenis blog yang lain akan memiliki pertanyaan yang sama dan tidak tahu jawabannya seperti gue sekarang.

"Aku Sadar Diriku Gila"

Hari ini gue landing di Soekarno Hatta jam 10.30 WIB.Rasanya ini jadual paling pagi nyampek di Cengkareng yang pernah gue alami.Biasanya rada siangan,sehingga gue ga isa ngejar jadual Journal Club yang diadakan jam 13.00 tiap hari selasa di IHVCB-UI*.Tapi gue berharap hari ini bisa mengejar jadual Journal Club jam 13.00,meski gue belum sempat baca jurnal yang akan dibahas yang biasanya sudah diattach via email,karena gue aja kelupaan ga liat hotmail kemaren.
Setelah perjalanan sekitar satu jam-an gue nyampek di kos,dan langsung cabut ke kampus setelah sebelumnya mampir dulu ke Bank Mandiri Salemba.Beruntung gue cuma telat 5 menit,sehingga gue bisa mengikuti pembahasan-nya yang hari ini mendiskusikan artikel : Mutant (V599E)B-Raf Regulates Growth and Vascular Development of Malignant Melanoma Tumors.Penyaji-nya sesuai tema yang diambil yaitu dokter spesialis kulit dan kelamin, dr.Aida S.D.Suriadiredja,SpKK. Abstrak-nya bisa dibaca di al's manuscript of gene therapy di menu protein "lectures dan seminar".
Hari ini gue free dan karena koneksi wi-fi di perpustakaan lagi jelek,jadi untuk membunuh waktu,jam 15.00 setelah Journal Club,gue pergi ke Gramedia,cari komik DDS...kali aja dugaan gue yang terdahulu bener.Maksudnya DDS ga jadi tamat..he..he..Tapi setelah periksa-periksa di rak bagian komik,ternyata seri terakhir yang ada masih seri 22.Yahhh..berarti DDS bener-bener tamat nih..:( Karena sasaran tidak ada di tempat, gue cuma muter-muter cari buku yang mungkin sesuai dengan selera.Memang bulan ini gue ga ada list buku yang gue buru.Lagian kayanya ga ada buku baru yang bagus bulan ini,yang gue liat di gramedia.Muter-muter dilantai dua Gramedia Matraman,hampir 3 jam-an...akhirnya mata gue nyampek ke sebuah buku yang keliatannya lumayan bagus.
Judulnya "Aku Sadar Diriku Gila" memoar seorang Psikiater,kisah nyata Dr.Kay Redfield Jamison,seorang profesor dan psikiater di Fakultas Kedokteran di Universitas John Hopkins.Rasanya buku ini bakal mengingatkan kembali materi kuliah dan coass di bangsal psikiatri dulu.Meski judulnya rada-rada gimana kaya gitu,tapi nama Uni John Hopkins kayanya jadi jaminan kisah ini cukup mempesona,seperti halnya novel Doctors-nya Erich Seagel yang mengambil Universitas Harvard sebagai settingnya.Jadi penasaran,euy!



*IHVCB-UI (Institut Human Virology and Cancer Biology-UI)

AL'S MANUSCRIPT OF GENE THERAPY

Pfuuhhh..akhirnya gue berhasil mengupload blog gene therapy ini,setelah susah payah selama dua hari bikin coding-nya.Bahkan sebenernya gue udah hampir hopeless,karena saat gue upload kok hasilnya tidak sesuai dengan saat sebelum di-upload.Dimana saat menu-nya klik,item link-nya cuma tampil sebentar aja seperti flash dan kok ada tanda window I.E-nya jalan sendiri dipojok.Aneh kan,padahal program ini ngelinknya hanya dalam program itu sendiri.Dan memang site ini gue buat secara offline dulu,dan saat upload-nya gue tinggal copy paste aja ke template blogger yang sebelumnya code bawaannya gue hapus semua kecuali code navbar yang susah banget untuk dihapus.Padahal gue udah puas dengan hasil coding offline-nya,tapi hasil uploadnya parah..malah sempat ada comment stack pada line 33.Weleeehh...setelah gue cek di line 33 normal aja.Gue utak-utik ga ada ngaruhnya.Salah dimana program gue ini ya..?Karena gue hopeless,gue akhirnya minta tolong ama Hebi,kali aja dia tahu letak kesalahan code gue.Setelah chatting dia bilang ada masalah pada kode tertentu yang masih kosong.Memang sih kode ini sengaja gue tulis untuk nantinya buat ng-link ke address tertentu dan sengaja gue kosongin karena pada badan code ini tidak ada fungsi link keluar program.Jadi gue kosongin aja...Taaaapi setelah gue pikir-pikir bener juga...coba deh gimana ya klo fungsi ini gue hapus aja yah?gue pikir klo ga ada link keluar buat apa fungsi ini dipake, meski secara offline tidak menimbulkan masalah.Dan setelah gue ilangin dan kembali gue upload dan gue refresh....bim salabim..tuiiing wahhhh..kerennnn banget man!Pas gue klik menunya ga ada flash seperti sebelumnya.Juga tidak muncul border yang cukup mengganggu pada item menu saat di klik.Wahhh benar-benar sesuai format offline-nya dan tampilan site-nya sesuai harapan gue banget...uiiihhh akhirnya!!! ga jadi malu dan muka gue terselamatkan...dasar pemula..hehehehe!!!Blog ini gue letakkan di "my core" item "gene therapy".
By the way,blog ini sengaja gue buat rada beda dan mungkin orang yang pertama kali membukanya akan rada kebingungan dengan format site ini...karena yang ada hanya gambar doang dan sedikit kata pengantar.Tapi itulah keunikan dan tantangan sebenarnya...hehehehe!!!

aL's MANUSCRIPT oF HacaTanO

Setelah berusaha hampir 12 jam full,akhirnya gue berhasil membuat blog khusus underground.Lama juga ya..namanya juga pemula...dan terus akan jadi pemula.Paling ga keliatan serem gitu loh...padahal hihii ya emang...serem..hahaha.Gue namain "aL's mANUSCRIPT oF HacaTanO".Agak aneh memang..."HacaTanO"?bahasa apaan tuh...Kata-kata ini pertama kali gue dapat saat gue semester 3 di Elektro ITS.Saat itu gue pingin banget jadi hacker..hua..hua..!Pengen mannn!Pengen aja,karena ternyata susah dan teramat susah untuk jadi hacker itu ternyata.Gue juga tahu diri kok,gue sadar gue ga secerdas Kevin Mitnick,Linus Trovald,Icebreaker,S'to ataupun Bill Gates.Nah...karena keinginan gue yang menggebu-gebu itu,meski otak gue gak sehebat mereka,setiap hari gue buka situs dan download tutorial-tutorial yang bersangkutan tentang masalah perhackingan dan computer security,baik bahasa Indonesia yang saat itu situs "Kecoak Elektronika" masih hebat sebagai rujukan,maupun yang bahasa Inggris.Bahkan ada juga tutorial yang berbahasa Rusia gue -ga sengaja-download.Gue saat itu download-nya di warnet kampus yang terbilang murah dibanding klo online diluar.Padahal seharusnya gue sebagai mahasiswa elektro dapet fasilitas gratis di lab.computing,tapi karena gue termasuk mahasiswa boikoter-mahasiswa yang ga ikut ospek jurusan/himpunan- gue tidak mendapatkan hak akses di lab tersebut.Sebenernya ini hanya peraturan bullshit dari para senior.Padahal itu salah satu motivasi gue double di elektro saat itu.Dapet akses internet gratis di lab.Ternyata sistemnya di jurusan ini brengsek banget. Jadi terpaksa deh gue akses-nya di warnet kampus atau perpus aja.

Semua download-an tentang tutorial itu gue simpan di disket yang jumlahnya kurang lebih 10 buah...ya satu kotak.Saat itu konyolnya gue ga punya komputer sendiri,jadi gue titipin di hardisk temen kos gue.Sekalian pinjem komputer untuk latihan..he..he..Namanya komputer pinjeman ya..belajarnya ga maksimal,apalagi gue orangnya ga enakan ama barang pinjeman...
Nah..diantara tutorial-tutorial itu ada tutorial yang berbahasa Rusia,yang gue sama sekali ga ngerti satu katapun.Juga huruf-hurufnya yang aneh itu.Diantara kata-kata yang bisa gue baca saat itu ya kata "HacaTanO".Tulisannya persis seperti itu,huruf H,T dan O ditulis besar,lainnya huruf kecil.Dan menurut perkiraan gue kata ini artinya hacker atau hacking.Tapi anehnya sekarang kata ini ketika gue search pake google,hasilnya nihil.Kok aneh ya.Tapi meski gitu karena gue udah terbiasa menggunakan kata ini dalam penamaan partisi hardisk,folder atau file yang berhubungan dengan data-data underground seperti software tools untuk hacking maupun cracking,maupun software yang berhasil gue crack.
Blog HacaTanO ini hanyalah sekedar "bullshit",yang hanya berisi angan-angan seorang Al yang bodoh padahal semuanya hanya omong kosong.Karena gue sendiri sebenarnya hanya-lah seorang newbie di dunia undreground ini.Bahkan mungkin hanya seorang lamer..."pemalas" yang ga tahu apa-apa tentang dunia hacker maupun cracker.
Pinginnya blog ini akan gue isi tutorial-tutorial yang pernah dan berhasil gue coba sendiri dengan menyertakan lika-likunya menjalankan teknik-teknik tersebut.Mungkin porsinya akan lebih banyak tentang cracking (software) ketimbang hacking.Karena alasan keamanan pribadi...he..he..he..Juga gue sertakan tool-tool yang mendukung tutorial tersebut.
Oya tentang gambar background tersebut meski udah gue edit sesuai karakter yang gue mau,gue udah minta ijin pada Sto yang memiliki hak cipta gambar itu...Gue juga sempat kebingungan saat background itu ga muncul-muncul saat upload meski pada akhirnya muncul sesuai harapan...dasar newbei...he..he..he.

dipermalukan Dealova

Setelah hunting VCD Film Dealova hampir satu bulan,akhirnya gue mendapatinya di Disc Tara Atrium Senen Jumat kemaren.Padahal pada hari sabtu tepat satu bulan yang lalu,gue juga nyari-nyari di tempat ini ..ya di Disc Tara Atrium senen ini,waktu itu barangnya ga ada,lagi kosong.Gue juga udah muter-muter di Mangga Dua trus Gramedia juga Gunung Agung untuk nyari benda ini,dan hasilnya nihil mulu.Ga tau karena laris atau pabriknya capek buat,VCD Dealova ini susah banget nemuinnya.Gue penasaran banget ama film ini,sejak gue jadi sentimentil dengerin soundtrack "Saat Kau Pergi"-nya Bunga.Gue sebenarnnya udah termasuk udzur nonton film ini,yang teen banget.Lagian ini film premiere-nya udah cukup lama.Tapi gimana yah...pengen gitu loh!Orang-orang sudah banyak tahu tentang film ini,eh gue kok belum.Apalagi katanya di TV novel yang merupakan ide dari film ini termasuk best selling.Satu hari gue juga sempat nonton acara yang menayangkan biografi dan keseharian penulis novel Dealova ini, si Dichil (Dian Kecil) alias Dian Nuranindya disalah satu TV swasta nasional.Hebat juga anak ini,gue pikir,baru umur kurang dari 20-an tahun udah bisa menulis novel yang bagus..dan di film-kan lagi.Ehmm...hope,someday I'll to be like her...as novelist.

By the way,baru sekarang gue muter film ini setelah gue nyampek di Balikpapan.Gue ga sempet muter di Jakarta,karena ga ada waktu santai sejak pulang dari Atrium kemaren.Parahnya film ini bikin gue malu banget,hiks..hiks..karena tenggorakan gue mulai terasa tercekat saat alur cerita masuk menit ke 06:12 lempeng CD kedua.Dan mata gue jadi pedih dan panas saat memasuki menit 13:13 lempeng kedua..dan puncaknya di lempeng CD yang sama di menit ke 20:12 saat lagu-nya Bunga terdengar..hiks...hiks..airmata gue..airmata gue...huwwaaa...gue nangis hiks..hiks.Habiss... temanya "gue banget" sih,jadi gue kaya review bahan ujian aja.Bahan ujian yang kelewat susah untuk dimengerti tapi harus dikerjain,dari Tuhan yang diujikan ke gue setaun yang lalu.Jadinya film ini berasa banget ke gue .Payah banget tuh si Dichil,ga punya perasaan apa ke gue yang pernah ngalamin hal seperti itu.Bisa-bisanya dia buat cerita kaya gituan dan bikin gue malu seperti barusan.Awas lu ya Chil,ntar lu bakal gue buat malu dua..tiga kali lipat malu yang gue rasakan sekarang dengan novel-novel gue nanti.Tapi rasanya bukan Dichil aja yang bikin gue malu seperti ini,si Dian Sasmita juga.Dia kan sutradara film-nya.Waaah..gimana caranya ngebuat dia malu ya...masak gue juga bikin film??Yang ini sih gue ga isa...samasekali ga isa dan ga minat.Ga potongan jadi sutradara boo...he..he..he.Ntar deh gue pikirin cara ngebalesnya. Jadi critanya nih,dua orang Dian telah mempermalukan gue yah...

Tapi gue mulai ga interes ama film ini saat memasuki menit ke 44:40 saat suara Once terdengar dengan lagu Dealova-nya.Karena gue belum pernah memasuki alur cerita ini dalam hidup gue,jadi gue ga bisa ngerasain gimana artinya alur cerita setelah menit itu diputar meski cuma beberapa saat aja sebelum film ini habis.Gue belum tahu rasanya.Jadi, gue dibuat jengkel banget ama ending-nya Dealova.Payaaaah.....